Le PEPR Sous-sol, bien commun cible cinq chantiers régionaux auxquels sont liés des types de ressources et des usages spécifiques du sous-sol.
- Le Fossé rhénan au potentiel géothermique profond ;
- Le centre du Bassin parisien, portant la plupart des enjeux socio-économiques en termes de gestion du sous-sol urbain ;
- La Guyane française, combinant un écosystème extraordinaire mais fragile, un sous-sol riche et méconnu ;
- Le Bassin aquitain pour le stockage de géo-ressources émergentes et les usages énergétiques ;
- Le Massif central pour l’étude des conditions géologiques et sociales de contribution du territoire aux transitions en cours.